Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms