Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GABARAPL3Q9BY60 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms