Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms