Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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