Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MESP1Q9BRJ9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms