Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms