Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms