Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF4Q99607 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms