Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP88Q99567 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms