Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SIN3AQ96ST3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIN3AQ96ST3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms