Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRAM1Q96QH2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms