Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC7Q96M83 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC7Q96M83 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms