Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms