Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJD4Q96KN9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms