Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRIQ1Q96JM4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRIQ1Q96JM4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRIQ1Q96JM4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRIQ1Q96JM4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRIQ1Q96JM4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRIQ1Q96JM4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRIQ1Q96JM4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
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