Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CHMP4CQ96CF2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP4CQ96CF2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms