Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms