Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN4Q92575 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms