Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSH3Q8TE77 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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