Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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