Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEA6

GLIS3, Zinc finger protein GLIS3, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3Q8NEA6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLIS3Q8NEA6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLIS3Q8NEA6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms