Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms