Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms