Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2M8

CLASRP, CLK4-associating serine/arginine rich protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASRPQ8N2M8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLASRPQ8N2M8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms