Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNMB4Q86W47 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms