Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD163Q86VB7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms