Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms