Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms