Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GDPD3Q7L5L3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDPD3Q7L5L3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDPD3Q7L5L3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDPD3Q7L5L3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDPD3Q7L5L3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDPD3Q7L5L3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDPD3Q7L5L3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDPD3Q7L5L3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDPD3Q7L5L3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDPD3Q7L5L3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDPD3Q7L5L3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDPD3Q7L5L3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDPD3Q7L5L3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDPD3Q7L5L3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDPD3Q7L5L3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDPD3Q7L5L3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDPD3Q7L5L3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms