Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED13LQ71F56 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms