Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN12Q6ZSI9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms