Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC129Q6ZRS4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms