Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms