Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFCAB12Q6NXP0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFCAB12Q6NXP0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms