Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NANOGP8Q6NSW7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms