Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms