Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms