Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1TD1Q5T7N2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms