Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEND3Q5T5X7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEND3Q5T5X7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEND3Q5T5X7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEND3Q5T5X7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND3Q5T5X7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND3Q5T5X7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND3Q5T5X7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND3Q5T5X7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND3Q5T5X7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND3Q5T5X7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND3Q5T5X7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND3Q5T5X7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND3Q5T5X7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND3Q5T5X7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND3Q5T5X7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND3Q5T5X7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND3Q5T5X7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND3Q5T5X7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND3Q5T5X7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms