Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms