Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITRM1Q5JRX3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms