Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms