Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC93Q567U6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms