Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RFTN2Q52LD8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms