Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYTL3Q4VX76 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms