Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms