Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ISXQ2M1V0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms