Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MICAQ29983 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MICAQ29983 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MICAQ29983 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MICAQ29983 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MICAQ29983 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MICAQ29983 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MICAQ29983 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MICAQ29983 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms