Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms