Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA3Q16787 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA3Q16787 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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